• Genom HEV terdiri daripada satu bebenang tunggal, molekul RNA positif dan bersaiz 7.2kb

​

• 5’ akhir genomik RNA ditutup dengan 7-methylguanosine (7 mG), manakala 3' akhir ditutup dengan “polyadenylated” (poly-A tail)

​

• Genomik RNA mengandungi 3 rangka bacaan terbuka (ORF).

​

• ORF1 mengkodkan protein bukan struktur, ORF2 mengkodkan protein teras yang membentuk kapsid dan ORF3 penting untuk pembebasan virus dan ia juga mengkodkan multifungsi protein kecil.

​

• Protein ORF2 dan ORF3 diterjemahkan dari satu mRNA tunggal, “bicistronic”.

​

• Terletak berhampiran dengan 5' akhir, ORF1 mengkodkan poliprotein bukan struktur dengan pelbagai domain berfungsi, termasuk untuk metilltransferase, protease, helicase, dan polimerase.

​

• Protein kapsid virus dikodkan oleh ORF2 berhampiran 3' akhir.

​

• ORF3, yang sebahagiannya bertindih dengan 2 ORFs lain, mengkodkan untuk protein imunogenik yang masih belum diketahui fungsinya.

​

• ORF3 mengkodkan 113 atau 114 asid amino phosphoprotein, bergantung kepada genotip tersebut.

​

• Protein kapsid ORF2, HEV-protein kapsid (HEV-CP), mengandungi sejumlah 660 residu asid amino.

​

• Di terminal-N HEV-CP ialah peptida isyarat diikuti oleh domain yang kaya dengan arginin yang berpotensi memainkan peranan dalam pengekstrakan RNA virus semasa pemasangan berlaku.

​

• HEV-CP adalah antigen utama yang merangsang tindak balas imun hos. Kini 6 domain antigen telah dikenalpasti.

​

• Satu tapak peneutralan telah dipetakan ke rantau polipeptida antara asid amino 452 dan 617.

​

• ORF yang baru, ORF4, baru-baru ini ditemui dalam kawasan pengekodan ORF1, tetapi hanya terhad kepada genotip 1 HEV.